咖啡樹的原產地在非洲的埃塞俄比亞。咖啡樹在植物學上，屬於茜草科咖啡亞屬的常綠樹，而一般所俗稱的咖啡豆，是咖啡樹所結果實的種子，因為形狀像豆子而被稱為咖啡豆。

氣候是咖啡種植的決定性因素，咖啡樹只適合生長在熱帶或亞熱帶，所以南北緯25度之間的地帶，最適合栽植咖啡。這個咖啡生產地帶一般稱為「咖啡帶」或「咖啡區」。

栽種高品質咖啡，需要陽光、雨量、土壤、氣溫等條件的配合。首先，產地溫度需介乎攝氏15-25℃之間；全年降雨量需達1,500-2,000毫米，同時其降雨時間，要能配合咖啡樹的開花週期。除季節及雨量的配合外，還需要肥活的土壤，而咖啡樹在充滿氮、碳酸鉀與磷酸的土壤中生長最茂盛。

此外，雖然日光是咖啡成長及結果不可欠缺的要素，但過於強烈的陽光會影響咖啡樹的成長，所以各個咖啡豆產地一般會配合而種植遮陽樹，一般多種植香蕉、芒果及豆科植物等樹幹較高的植物。

栽種咖啡樹最理想的海拔高度為500至2000米，並以生長於海拔800至1200米的牙買加藍山咖啡，其品質被譽為最佳。當然，咖啡豆採收的方式和製作過程，亦影響咖啡本身的品質。

咖啡樹第一次開花期約為樹齡3年左右，白色的五瓣筒狀花朵，飄散淡淡茉莉花香，花序濃密而成串排列。花朵開花兩三日後即會凋謝，幾個月後開始結出果實。

咖啡果實為核果，直徑約1.5厘米，最初呈綠色，後漸漸變黃，成熟後轉為紅色，和櫻桃非常相似，因此稱為櫻桃咖啡（Coffee Cherry），此時即可採收。

咖啡果實內含有兩顆種子，那就是咖啡豆。該兩顆豆子各以其平面的一邊，面對面直立相連。每粒咖啡豆都有一層薄薄的外膜，此膜被稱為銀皮，其外層又披著一層黃色的外皮，稱為內果皮。整粒咖啡豆被包藏在黏質性的漿狀物中，形成咖啡果肉，果肉軟且帶有甜味，最外層則為外殼。

咖啡樹一年有一次長達 4至8個月的收成，其花及果實在成熟期不同階段同時並存，咖啡的品質受大自然變化所影響。果子長得過熟，內裡的豆子會爛掉；不夠熟，則採下來的豆子不會自己變熟。因此，採豆工人要經常到同一棵咖啡樹，尋找成熟的果子，一棵1.8米至2米高的咖啡樹，約有2.5至3.5公斤的果實，經加工，包括去除果肉至豆子乾透，約只剩下2公斤左右的咖啡生豆。